Bien qu’ils soient gérés par une même équipe et avec un budget commun, il faut distinguer la gestion du bois (des Capucins) de celle de l’arboretum. La gestion du bois est axée vers un objectif multifonctionnel, et vise à garder un équilibre durable entre conservation de la nature, activités récréatives et rendement sylvicole. La gestion de l’arboretum vise en première instance au maintien des collections et à la préservation du paysage, tout en prenant en compte, là où cela est possible, les richesses naturelles locales. La gestion du domaine forestier est statutairement garantie par les dispositions constitutives de la Donation Royale et le territoire bénéficie de quasi toutes les mesures de protection existantes en matière de patrimoine ou d’espace naturel au niveau local ou européen.